Backups nunca são demais, infelizmente quando o assunto é o backup de emails baseados na web como o Gmail isto pode se torna mais complicado, ainda mais para quem não usa um cliente com pop configurado.
E o problema com o Gmail é que nunca sabemos quando o Google vai puxar o plug das nossas contas .
Mas para isto existe o Gmvault que ira ajuda-lo a fazer o backup de tudo na sua conta do Gmail, atualmente o software é beta e um pouco não amigável, recomendo para quem ja tenha um pouco mais de experiência no mundo dos scripts e arquivos .bat.
O aplicativo é escrito em Python e é rodado via linha de comando, você pode configurar um cron ( Linux agendamento de tarefas ) para rodar o script de vez em quando e manter um backup atualizado.
Tenho usado ele faz alguns dias e é prático quando você esquece de abrir o ThunderBird de vez em quando para mante-lo atualizado.
